编码，编码序列分析和基因预测在线数据库资源

搜索此全面的 BAC 资源，以找到不同物种的每个 BAC 的可用映射，序列，注释和功能数据。

搜索和分类原核移动遗传元件（MGEs）。

通过比较进化相关生物的基因组序列来预测基因。

查找有关脊椎动物 mRNA 3’ 非翻译区（UTR）中的富 Au 元素的信息。

基于广义隐马尔可夫模型预测真核基因组序列中的基因。

可搜索的 ORF 的数据库，包含 600 多个完全测序的微生物基因组。

预测 DNA 序列中假定的细菌素开放阅读框（ORF）。

检测并显示具有统计意义的位置特定序列偏倚，并降低背景噪声。

查找核苷酸序列中的载体污染。

查找怀疑含有编码序列的区域，并可视化两个基因组或基因序列之间的核苷酸多样性。

通过跨物种基因组比较鉴定编码和非编码保守序列标签。

从 23093 个生物的列表中找到该生物的密码子使用总和（2004 年）。

搜索人类，小鼠和大鼠基因组中的融合序列。

测量基因组内和跨基因组的同义密码子使用偏倚。

在长序列中搜索低复杂度区域，并估计比对序列组的复杂度。

在核苷酸序列中找到 CpG 岛。

查找有关二核苷酸分子特性的信息。

根据同源序列的比较分析预测真核基因。

预测并统计评估预测的原核开放阅读框（ORF）。

在 NCBI 数据库中搜索基因特异性信息。

从 GenBank 条目和其他 GenBank 格式文件中提取序列和特征注释，例如内含子 / 外显子结构。

预测原核和成熟的真核序列中的编码区。

为使用遗传算法选择最佳密码子而开发的算法。

基于基因组签名范例对核苷酸序列进行表征和分类。

预测脊椎动物，无脊椎动物和植物的基因组序列中基因的位置和外显子内含子结构。

预测编码序列。

比较 DNA 序列的遗传（编码 / 非编码）和物理（螺旋 / 螺旋）分割。

预测原核，真核和病毒基因组序列中的基因。

使用不同的软件工具预测 DNA 序列中的基因。

筛选人类基因组的人类内源性逆转录病毒（HERV）。

搜索有关注释完整基因组中已处理假基因的信息。

搜索人类基因组中的减数分裂重组点。

可视化来自 ISfinder 的原核基因组中的插入序列。

搜索细菌插入序列（ISs）。

可以访问序列数据库以及许多核酸和蛋白质序列分析工具。

要搜索原核基因组 DNA 序列中的岛屿，并分析相关整合的系统发育。

使目标基因密码子用法适应表达宿主，以改善异源蛋白质合成。

在基因组序列中找到全长 LTR 反转录转座子。

预测生物序列中的特征。

搜索从完全测序的原核基因组中提取的非冗余微卫星。

在分子水平上检测自然选择的特征。

在此综合资源中找到 microRNA 靶标预测和表达谱。

查找核苷酸序列中存在的开放阅读框（ORF）。

从下一代测序数据中找到有关甲基化数据的信息。

搜索有关核小体形成位点的位置和特征的实验数据。

一个在线 PHP 应用程序，可优化 DNA 序列的密码子用法以增加其表达水平。

分析来自哺乳动物和真菌的大量 EST 或 cDNA。

搜索不断发展的人类和小鼠开放阅读框（ORF）克隆（UltimateTM ORF 克隆）的集合。

用于微阵列数据聚类和跨物种分析的 Web 平台。

识别表达的序列标签（EST）衍生的序列中的蛋白质编码区。

预测简短的环境 DNA 序列中的蛋白质编码基因。

从 55 个物种中搜索预测的直系同源物组。

预测 miRNA 基因。

屏蔽 EST 重复序列，无需使用库。

通过对 L1 介导的插入基因组中的签名结果进行评分来跟踪逆转座序列。

查找代表基因组，转录本和蛋白质的序列。

从所有同行评审的研究中搜索合成（人工工程）基因的序列和相关实验信息。

在人类基因组中搜索短串联重复序列 DNA。

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